AUTOMATIC GRIDDING CITRA MICROARRAY DENGAN MENGGUNAKAN IMAGE THRESHOLDING

Siswantoro, Joko (2010) AUTOMATIC GRIDDING CITRA MICROARRAY DENGAN MENGGUNAKAN IMAGE THRESHOLDING. In: Konferensi Nasional Matematika XV, 30 Juni-3 Juli 2010, Manado.

[img]
Preview
PDF
Proc KNMXV.pdf - Published Version

Download (1692Kb) | Preview

Abstract

.Citra microarray adalah citra hasil pemindaian laser scanner terhadap microarray yang umumnya digunakan untuk mendeteksi perbedaan efek hibridisasi dari dua kelompok sampel DNA. Citra tersebut kemudian dianalisis untuk mendapatkan intensitas fluorescence setiap titik mikroskopis DNA pada microarray. Salah satu tahapan analisis citra microarray adalah menentukan daerah pada citra microarray yang memuat satu titik mikroskopis DNA. Penentuan daerah ini dapat dilakukan secara manual maupun secara otomatis atau yang dikenal dengan automatic gridding. Beberapa penelitian menggunakan k-mean clustering untuk melakukan automatic gridding, tetapi metode ini membutuhkan waktu komputasi yang cukup lama. Dalam makalah ini akan dipaparkan metode untuk automatic gridding dengan menggunakan image thresholding. Selain itu juga dilakukan simulasi dengan menggunakan MATLAB untuk membandingkan waktu yang diperlukan untuk komputasi automatic gridding dengan image thresholding dan automatic gridding dengan k-mean clustering. Hasil simulasi menunjukkan bahwa waktu komputasi automatic gridding dengan image thresholding jauh lebih sedikit di bandingkan dengan automatic gridding dengan k-mean clustering.

Item Type: Conference or Workshop Item (Paper)
Uncontrolled Keywords: automatic gridding, microarray, fluorescence, image thresholding
Subjects: Q Science > QA Mathematics > QA75 Electronic computers. Computer science
Divisions: Faculty of Engineering > Department of Informatic
Depositing User: Joko Siswantoro
Date Deposited: 22 Mar 2018 01:58
Last Modified: 16 May 2018 02:59
URI: http://repository.ubaya.ac.id/id/eprint/31880

Actions (login required)

View Item View Item