Johan, Calvin Wijaya and Putra, Sulistyo Emantoko Dwi and Suryadjaja, Ernest (2020) Deteksi Vibrio Harveyi Dengan Metode Amplifikasi DNA pada Gen toxR. KELUWIH: Jurnal Sains dan Teknologi, 1 (1). pp. 29-37. ISSN 2721-2432
PDF
Emantoko_Deteksi Vibrio harveyi dengan Metode Amplifikasi DNA pada Gen toxR.pdf Download (2MB) |
Abstract
Infeksi hewan akuakultur oleh Vibrio harveyi dapat menyebabkan kematian serta kerugian ekonomi. Kemampuan untuk mendeteksi bakteri tersebut secara dini dapat mencegah penyebarannya dalam akuakultur. Penelitian ini bertujuan mengembangkan metode untuk mendeteksi Vibrio harveyi melalui amplifikasi gen toxR. Amplifikasi DNA dilakukan dengan dua metode, yakni amplifikasi isotermal termediasi loop (loop-mediated isothermal amplification, LAMP) dan reaksi berantai polimerase (PCR). Amplifikasi menggunakan metode LAMP menunjukkan perlu dilakukan optimasi protokol maupun desain primer untuk mencegah perolehan hasil false positive. Amplifikasi menggunakan metode PCR menghasilkan produk berukuran 229 pasang basa yang spesifik pada Vibrio harveyi dengan batas deteksi hingga 0,526 ng.μL-1 (setara 2,09 × 106 CFU.mL-1).
Item Type: | Article |
---|---|
Uncontrolled Keywords: | Akuakultur, LAMP, PCR, toxR, Vibrio harveyi |
Subjects: | T Technology > T Technology (General) |
Divisions: | Faculty of Technobiology > Department of Biology |
Depositing User: | Ester Sri W. 196039 |
Date Deposited: | 10 May 2021 08:17 |
Last Modified: | 10 May 2021 08:17 |
URI: | http://repository.ubaya.ac.id/id/eprint/39521 |
Actions (login required)
View Item |